Com formação em Medicina, Manuel Sobrinho Simões é, desde o arranque em 1989, director do Instituto de Patologia e Imunologia Molecular da Universidade do Porto (IPATIMUP), classificado como instituição de excelência nos domínios da investigação científica, ensino após-a-graduação e divulgação científico-cultural.

Licenciou-se em Medicina na Faculdade de Medicina do Porto em 1971. Doutorou-se em Patologia na Faculdade de Medicina do Porto em 1979. Fez o pós-doutoramento no Instituto de Cancro da Noruega  (Oslo) em
1979 e 1980. É especialista em patologia ultrastrutural, oncobiologia (causas e diagnóstico do cancro), patologia da tireóide e patologia do estômago, Professor Catedrático de Anatomia Patológica na Faculdade de
Medicina do Porto desde 1988 e Chefe de Serviço no Hospital de S. João desde 1989.

Desde 1990, Sobrinho Simões é Professor Adjunto de Patologia e Biologia Celular na Universidade Thomas Jefferson de Filadélfia.
Presidiu à Sociedade Europeia de Patologia de 1999 a 2001, tendo aí ocupado outros cargos desde 1987. É membro dos Conselhos Científicos da Escola Europeia de Patologia, do Curso Europeu de Patologia Celular,  da Associação Europeia de Prevenção de Cancro e da Associação Internacional de Cancro Gástrico. Colabora como expert com
a Associação de Directores de Patologia Cirúrgica dos EUA (ADASP) e com  o American Board of Pathology.

É especialista convidado do Centro de Telepatologia da União Internacional Contra o Cancro sediado na Charité, Humboldt University, Berlim, que realiza trabalho de consulta para todo o mundo. Para além dessa actividade realiza anualmente, no IPATIMUP, cerca de 300 casos de consulta diagnóstica para hospitais da Europa, EUA e América do
Sul.

É sócio honorário da Academia Real de Ciências Médicas da Catalunha e Ilhas Baleares, Sociedade Brasileira de Cancerologia,Sociedade Espanhola de Anatomia Patológica, Sociedade Médica de Córdoba e Sociedades Portuguesas de Endocrinologia e de Cirurgia. É professor honorário da Faculdade de Medicina da Universidade de Zhengzhou e foi professor visitante em cerca de 30 universidades e institutos de oncologia europeus, norte-americanos, latino-americanos e asiáticos.

Orientou o doutoramento de mais de 30 médicos e cientistas portugueses e estrangeiros. Foi autor ou co-autor de cerca de 300 artigos em revistas científicas internacionais indexadas que deram origem a mais de 8000 citações.

Entre os cerca de 20 livros e capítulos de livros de que foi autor ou co-autor contam-se o “handbook” da União Internacional Contra o Cancro “Comprehensive Tumour Terminology” (2000) e o livro  “Ultrastructural Pathology” publicado pela Hemisphere Publishing Corporation, nos EUA, em 1990, traduzido no Japão em 1995. Co-editou o livro “Os Outros em Eu” no âmbito da PORTO-2001. Escreveu vários capítulos do livro “Pathology and Genetics of Tumours of Endocrine Organs”, publicado em 2004 pela Organização Mundial de Saúde, e utilizado em todo o mundo como referência classificativa dos tumores endócrinos.  É autor do livro “Gene, Célula, Ciência, Homem”.

Recebeu o Prémio Bordalo – Ciência (1996), Prémio Seiva Trupe - Ciência (2002) e o Prémio Pessoa (2002), e também Medalha de Mérito da Cruz Vermelha Portuguesa (2001), Medalhas de Ouro da CM de Arouca (2002) e da CM do Porto (2003), Comandante e Grande Oficial da Ordem Real da Noruega (2003 e 2010) e Grã-Cruz da Ordem do Infante D.
Henrique (2004). Preside ao Júri do Prémio BIAL (2005).